Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nphp3Q7TNH6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nphp3Q7TNH6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms