Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd3eapQ76KJ5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Cd3eapQ76KJ5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd3eapQ76KJ5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms