Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sned1Q70E20 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sned1Q70E20 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sned1Q70E20 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms