Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RfflQ6ZQM0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RfflQ6ZQM0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RfflQ6ZQM0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RfflQ6ZQM0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RfflQ6ZQM0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RfflQ6ZQM0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RfflQ6ZQM0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RfflQ6ZQM0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RfflQ6ZQM0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RfflQ6ZQM0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RfflQ6ZQM0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RfflQ6ZQM0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RfflQ6ZQM0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RfflQ6ZQM0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RfflQ6ZQM0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RfflQ6ZQM0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms