Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Nup188Q6ZQH8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nup188Q6ZQH8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms