Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Topbp1Q6ZQF0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Topbp1Q6ZQF0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms