Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NinlQ6ZQ12 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NinlQ6ZQ12 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NinlQ6ZQ12 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NinlQ6ZQ12 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NinlQ6ZQ12 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NinlQ6ZQ12 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NinlQ6ZQ12 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NinlQ6ZQ12 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NinlQ6ZQ12 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NinlQ6ZQ12 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NinlQ6ZQ12 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NinlQ6ZQ12 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NinlQ6ZQ12 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
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