Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ino80Q6ZPV2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ino80Q6ZPV2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms