Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smpd4Q6ZPR5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms