Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc88cQ6VGS5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc88cQ6VGS5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms