Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Casc1Q6TDU8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Casc1Q6TDU8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casc1Q6TDU8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms