Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt9Q6RHW0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt9Q6RHW0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms