Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE4

Znf316, Zinc finger protein 316, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf316Q6PGE4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Znf316Q6PGE4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf316Q6PGE4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf316Q6PGE4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf316Q6PGE4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf316Q6PGE4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf316Q6PGE4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf316Q6PGE4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf316Q6PGE4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms