Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HjurpQ6PG16 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HjurpQ6PG16 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HjurpQ6PG16 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HjurpQ6PG16 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HjurpQ6PG16 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HjurpQ6PG16 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HjurpQ6PG16 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HjurpQ6PG16 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HjurpQ6PG16 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HjurpQ6PG16 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HjurpQ6PG16 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HjurpQ6PG16 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HjurpQ6PG16 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HjurpQ6PG16 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HjurpQ6PG16 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HjurpQ6PG16 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HjurpQ6PG16 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HjurpQ6PG16 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HjurpQ6PG16 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HjurpQ6PG16 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms