Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smarcc2Q6PDG5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarcc2Q6PDG5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcc2Q6PDG5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms