Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gapvd1Q6PAR5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gapvd1Q6PAR5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gapvd1Q6PAR5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms