Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NesQ6P5H2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NesQ6P5H2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms