Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Podnl1Q6P3Y9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Podnl1Q6P3Y9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Podnl1Q6P3Y9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms