Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrimpolQ6P1E7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PrimpolQ6P1E7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrimpolQ6P1E7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrimpolQ6P1E7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PrimpolQ6P1E7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrimpolQ6P1E7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrimpolQ6P1E7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrimpolQ6P1E7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrimpolQ6P1E7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PrimpolQ6P1E7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrimpolQ6P1E7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrimpolQ6P1E7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PrimpolQ6P1E7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrimpolQ6P1E7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrimpolQ6P1E7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrimpolQ6P1E7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrimpolQ6P1E7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrimpolQ6P1E7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrimpolQ6P1E7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrimpolQ6P1E7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrimpolQ6P1E7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrimpolQ6P1E7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrimpolQ6P1E7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms