Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rprd2Q6NXI6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rprd2Q6NXI6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rprd2Q6NXI6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms