Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Colgalt2Q6NVG7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Colgalt2Q6NVG7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms