Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdcd11Q6NS46 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pdcd11Q6NS46 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pdcd11Q6NS46 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms