Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc66Q6NS45 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc66Q6NS45 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc66Q6NS45 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms