Protein–RNA interactions for Protein: Q6IS41

Slc25a47, Solute carrier family 25 member 47, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a47Q6IS41 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc25a47Q6IS41 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc25a47Q6IS41 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc25a47Q6IS41 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc25a47Q6IS41 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc25a47Q6IS41 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc25a47Q6IS41 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc25a47Q6IS41 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc25a47Q6IS41 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc25a47Q6IS41 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc25a47Q6IS41 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc25a47Q6IS41 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc25a47Q6IS41 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc25a47Q6IS41 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc25a47Q6IS41 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc25a47Q6IS41 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc25a47Q6IS41 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc25a47Q6IS41 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc25a47Q6IS41 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc25a47Q6IS41 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc25a47Q6IS41 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc25a47Q6IS41 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Slc25a47Q6IS41 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc25a47Q6IS41 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a47Q6IS41 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a47Q6IS41 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a47Q6IS41 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a47Q6IS41 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms