Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep78Q6IRU7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep78Q6IRU7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms