Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm4Q6IRU2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm4Q6IRU2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tpm4Q6IRU2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
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