Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf8Q6DID3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf8Q6DID3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms