Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Smarca2Q6DIC0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Smarca2Q6DIC0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Smarca2Q6DIC0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms