Protein–RNA interactions for Protein: Q6A051

Atrnl1, Attractin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atrnl1Q6A051 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atrnl1Q6A051 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Atrnl1Q6A051 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atrnl1Q6A051 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atrnl1Q6A051 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Atrnl1Q6A051 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Atrnl1Q6A051 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atrnl1Q6A051 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Atrnl1Q6A051 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Atrnl1Q6A051 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Atrnl1Q6A051 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atrnl1Q6A051 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Atrnl1Q6A051 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atrnl1Q6A051 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atrnl1Q6A051 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atrnl1Q6A051 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atrnl1Q6A051 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atrnl1Q6A051 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atrnl1Q6A051 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atrnl1Q6A051 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atrnl1Q6A051 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atrnl1Q6A051 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atrnl1Q6A051 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atrnl1Q6A051 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atrnl1Q6A051 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Atrnl1Q6A051 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atrnl1Q6A051 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms