Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdzrn3Q69ZS0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdzrn3Q69ZS0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzrn3Q69ZS0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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