Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msl2Q69ZF8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Msl2Q69ZF8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.3 ms