Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lrrc8eQ66JT1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrc8eQ66JT1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms