Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Surf4Q64310 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf4Q64310 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms