Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nhlh2Q64221 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlh2Q64221 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms