Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim24Q64127 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim24Q64127 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms