Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Gm20865Q62460 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20865Q62460 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20865Q62460 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20865Q62460 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20865Q62460 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20865Q62460 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20865Q62460 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20865Q62460 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20865Q62460 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20865Q62460 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20865Q62460 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20865Q62460 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20865Q62460 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20865Q62460 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20865Q62460 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20865Q62460 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20865Q62460 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20865Q62460 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20865Q62460 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20865Q62460 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20865Q62460 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20865Q62460 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20865Q62460 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms