Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

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Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sp4Q62445 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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Sp4Q62445 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Sp4Q62445 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sp4Q62445 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
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