Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tff3Q62395 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tff3Q62395 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms