Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AtmQ62388 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AtmQ62388 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AtmQ62388 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtmQ62388 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AtmQ62388 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AtmQ62388 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AtmQ62388 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AtmQ62388 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AtmQ62388 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AtmQ62388 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AtmQ62388 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AtmQ62388 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms