Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Taf6Q62311 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf6Q62311 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms