Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spock1Q62288 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spock1Q62288 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms