Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SypQ62277 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SypQ62277 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SypQ62277 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SypQ62277 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SypQ62277 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SypQ62277 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SypQ62277 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SypQ62277 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SypQ62277 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SypQ62277 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SypQ62277 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SypQ62277 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SypQ62277 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SypQ62277 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SypQ62277 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SypQ62277 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SypQ62277 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SypQ62277 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SypQ62277 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SypQ62277 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SypQ62277 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SypQ62277 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SypQ62277 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SypQ62277 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SypQ62277 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SypQ62277 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SypQ62277 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SypQ62277 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SypQ62277 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SypQ62277 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SypQ62277 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SypQ62277 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SypQ62277 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SypQ62277 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SypQ62277 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SypQ62277 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SypQ62277 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SypQ62277 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SypQ62277 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SypQ62277 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SypQ62277 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SypQ62277 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SypQ62277 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SypQ62277 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SypQ62277 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SypQ62277 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SypQ62277 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SypQ62277 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SypQ62277 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SypQ62277 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SypQ62277 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SypQ62277 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SypQ62277 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SypQ62277 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SypQ62277 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SypQ62277 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SypQ62277 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SypQ62277 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SypQ62277 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SypQ62277 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SypQ62277 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SypQ62277 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SypQ62277 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SypQ62277 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SypQ62277 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SypQ62277 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SypQ62277 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SypQ62277 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SypQ62277 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SypQ62277 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SypQ62277 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SypQ62277 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SypQ62277 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SypQ62277 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SypQ62277 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SypQ62277 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SypQ62277 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SypQ62277 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SypQ62277 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SypQ62277 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SypQ62277 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SypQ62277 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SypQ62277 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SypQ62277 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SypQ62277 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SypQ62277 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SypQ62277 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SypQ62277 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SypQ62277 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SypQ62277 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SypQ62277 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SypQ62277 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SypQ62277 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SypQ62277 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SypQ62277 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SypQ62277 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SypQ62277 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SypQ62277 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SypQ62277 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms