Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Kdm5dQ62240 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Kdm5dQ62240 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Kdm5dQ62240 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Kdm5dQ62240 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms