Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sycp1Q62209 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sycp1Q62209 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sycp1Q62209 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sycp1Q62209 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sycp1Q62209 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms