Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33bQ61897 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt33bQ61897 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt33bQ61897 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt33bQ61897 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt33bQ61897 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt33bQ61897 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt33bQ61897 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt33bQ61897 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt33bQ61897 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt33bQ61897 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt33bQ61897 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt33bQ61897 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt33bQ61897 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt33bQ61897 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt33bQ61897 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt33bQ61897 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt33bQ61897 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt33bQ61897 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt33bQ61897 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt33bQ61897 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt33bQ61897 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 457.4 ms