Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vsx2Q61412 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vsx2Q61412 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms