Protein–RNA interactions for Protein: Q61210

Arhgef1, Rho guanine nucleotide exchange factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 920 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef1Q61210 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arhgef1Q61210 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Arhgef1Q61210 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Arhgef1Q61210 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arhgef1Q61210 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms