Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxf1Q61080 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxf1Q61080 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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