Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TmpoQ61033 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TmpoQ61033 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms