Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkn2dQ60773 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkn2dQ60773 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms